MS Spectra berechnen

Maracuja · Gast

Meine Frage:
Die Aufgabe besteht darin die MS1 und MS2 Vorhersagen für das Peptid SFVK (Massen: S:87.08, F: 165,19, V:117.15, K: 146.19) zu treffen. Außerdem ist die Wassermasse 18.02.

Meine Ideen:
Ich würde erst einmal die Masse vom Peptid berechnen, also monoisotopische Masse (S+F+V+K) + Masse Wasser. Das wären 533.63
Weiter weiß ich leider nicht ...

willy · Anmeldungsdatum: 22.07.2020 Beiträge: 329

Bei einer Peptidbindung wird ja Wasser abgespalten. Du kannst also nicht einfach die Massen der AS addieren!

OC-Gast · Gast

Die molare Masse für Serin paßt hier schon nicht,das wären 105,1 g/mol.
Der Molekülpeak für das obige Tetrapeptid sollte bei 479 liegen
(M(aver):479,56 g/mol ,M(mono):478,26 g/mol).)
Das wäre der Peak im MS1-Spektrum.
Was kennst du für Fragmentierunsreaktionen bei Peptiden?

OC-Gast.